详情介绍
真菌基因组DNA提取试剂盒
试剂盒组成 | 50T | 200T | 保存温度 |
RNaseA(10mg/ml) | 500ul | 2ml | -20℃ |
蛋白酶K(10mg/ml) | 500ul | 2ml | -20℃ |
玻璃珠 | 5g | 20g | RT |
裂解液 | 15ml | 60ml | RT |
结合液 | 25ml | 100ml | RT |
玻璃奶 | 1ml | 4ml | RT |
TE缓冲液 | 10ml | 30ml | RT |
原理简介
真菌是具有真核和细胞壁的异养生物。种属很多,已报道的属达1万以上,种超过10万个。真菌通常又分为三类,即酵母菌、霉菌和蕈菌(大型真菌)。对于酵母菌和霉菌,可以用玻璃珠处理,而对于大型真菌,可直接用液液氮研磨。经过前期处理的菌液,再经过裂解液及蛋白酶处理后,玻璃奶吸附DNA,去掉其他杂质,,可得到高纯度的基因组。提取纯化后的DNA,可以直接用于 PCR/Real time-PCR,sequencing,Southern blot,mutant analysis,SNP 等下游应用实验。
注意事项
1.由于真菌种类万千,对于一些特别难处理的真菌,可用液氮研磨,再用玻璃珠振荡,蛋白酶K处理,一般都可以得到一定量的基因组DNA,如电泳检测很弱,一般PCR都会有较好结果。
2.如果DNA提取量很少,可加长玻璃珠处理时间,如果提取DNA PIAN段很短,成弥散条带,可减少玻璃珠处理时间。
操作步骤
1.样品的处理:
1)对于酵母菌,取1-2ml培养好的菌液,离心收集,弃上清。加入300ul 裂解液,加入10ul RNase A,再加入100mg玻璃珠,在高速振荡器上振荡,约5-10min。
2)霉素(孢子也可相同处理):取50-100mg菌丝,加300ul裂解液,用玻璃研磨器适当研磨分散菌丝,加入10ulRNase A,再加入100mg玻璃珠,在高速振荡器上振荡,约30min。
3)大型真菌(如蘑菇等):称取50-100mg样品,倒入适量的液氮,立即研磨重复3 次,使样品研成粉末(如无液氮,可加300ul裂解液后用玻璃研磨器适当研磨),加300ul裂解液,加入10ul RNase A,再加入100mg玻璃珠,在高速振荡器上振荡,约5min。
2.加入10ul 10mg/ml的蛋白酶K,充分混匀,55℃水浴消化,15-30min。消化期间可颠倒离心管混匀数次。
3.12000转离心2min。将上清转移到一个新的离心管中。如有沉淀,可再次离心。
4.在上清中加入三倍体积无水乙醇,充分混匀。
5.12000rpm离心5分钟,去上清,核酸在沉淀中。
6.沉淀中加入500ul结合液,55℃水浴1-2分钟,核酸沉淀可溶解。
6.玻璃奶摇匀。加入50ul摇匀的玻璃奶,混匀,室温放置2分钟,10000转/分钟离心1分钟,去上清;沉淀加入1ml 70%乙醇,振荡混匀,10000转/分钟离心1分钟,去上清,70%乙醇重复洗一次,再用无水乙醇洗一次。去上清,再次离心2分钟,用小吸头吸去上清。
7.室温放置10分钟(如果玻璃奶加量,请适当延长放置时间,此步为去除残余酒精,以免影响下游实验),加入50-100ul TE缓冲液混匀溶解,55℃水浴5分钟。离心,取上清为所提基因组。
8.电泳或者其他方法检测,进入下游实验。